さらに新機能「バイザーシステム」が導入されたことで、メトロイドシリーズの醍醐味である謎解き要素も一層充実。局面に応じて４種類のバイザーを使い分けることが惑星 ターロンIV 攻略のカギになる。 　サムス視点のほかにも、モーフボール（丸まり状態）時の客観視点プレイや、随所にインサートされるカットインムービーによる演出が巧みに紡ぎ合わされ、いわゆる既存のＦＰＳ とは一線を画 する作品に。 　薄暗い洞窟を進む「恐さ」、飛び交うビーム攻撃をくぐり抜ける「スリル」、パワーアップアイテム を苦心の末発見する「達成感」など "メトロイドらしさ" は残しつつも、これらの新 システムによってメトロイドプライムは新たな面白さをプレイヤーに提供する。